pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO

pritamdeka
Similitud de oraciones

Este es un modelo de sentence-transformers: Mapea oraciones y párrafos a un espacio vectorial denso de 768 dimensiones y se puede usar para tareas como clusters o búsqueda semántica. Es el modelo microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract-fulltext que ha sido afinado con el conjunto de datos MS-MARCO utilizando el marco de trabajo de sentence-transformers. Se puede utilizar para la tarea de recuperación de información en el dominio del texto médico/salud.

Como usar

Uso (Sentence-Transformers)

Usar este modelo es fácil cuando tienes sentence-transformers instalado:

pip install -U sentence-transformers

Entonces puedes usar el modelo así:

from sentence_transformers import SentenceTransformer
sentences = ["Esta es una oración de ejemplo", "Cada oración es convertida"]

model = SentenceTransformer('pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO')
embeddings = model.encode(sentences)
print(embeddings)

Uso (HuggingFace Transformers)

Sin sentence-transformers, puedes usar el modelo así: Primero, pasa tu entrada a través del modelo transformer, luego tienes que aplicar la operación de pooling correcta encima de las embeddings de palabras contextualizadas.

from transformers import AutoTokenizer, AutoModel
import torch

# Pooling media - Ten en cuenta el mask de atención para un promedio correcto
def mean_pooling(model_output, attention_mask):
    token_embeddings = model_output[0] # El primer elemento de model_output contiene todas las embeddings de tokens
    input_mask_expanded = attention_mask.unsqueeze(-1).expand(token_embeddings.size()).float()
    return torch.sum(token_embeddings * input_mask_expanded, 1) / torch.clamp(input_mask_expanded.sum(1), min=1e-9)

# Oraciones para las que queremos embeddings de oraciones
sentences = ['Esta es una oración de ejemplo', 'Cada oración es convertida']

# Carga el modelo desde HuggingFace Hub
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained('pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO')
model = AutoModel.from_pretrained('pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO')

# Tokeniza las oraciones
encoded_input = tokenizer(sentences, padding=True, truncation=True, return_tensors='pt')

# Calcula las embeddings de tokens
with torch.no_grad():
    model_output = model(**encoded_input)

# Realiza pooling. En este caso, pooling media.
sentence_embeddings = mean_pooling(model_output, encoded_input['attention_mask'])

print("Embeddings de oraciones:")
print(sentence_embeddings)

Funcionalidades

Modelo de sentence-transformers
Afina el modelo BiomedNLP-PubMedBERT
Capacidad de mapeo a espacio vectorial denso de 768 dimensiones
Tareas de clusters o búsqueda semántica
Optimizado para el dominio de texto médico/salud

Casos de uso

Agrupamiento de oraciones o párrafos
Búsqueda semántica
Recuperación de información en el dominio del texto médico/salud