pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO
Este es un modelo de sentence-transformers: Mapea oraciones y párrafos a un espacio vectorial denso de 768 dimensiones y se puede usar para tareas como clusters o búsqueda semántica. Es el modelo microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract-fulltext que ha sido afinado con el conjunto de datos MS-MARCO utilizando el marco de trabajo de sentence-transformers. Se puede utilizar para la tarea de recuperación de información en el dominio del texto médico/salud.
Como usar
Uso (Sentence-Transformers)
Usar este modelo es fácil cuando tienes sentence-transformers instalado:
pip install -U sentence-transformers
Entonces puedes usar el modelo así:
from sentence_transformers import SentenceTransformer
sentences = ["Esta es una oración de ejemplo", "Cada oración es convertida"]
model = SentenceTransformer('pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO')
embeddings = model.encode(sentences)
print(embeddings)
Uso (HuggingFace Transformers)
Sin sentence-transformers, puedes usar el modelo así: Primero, pasa tu entrada a través del modelo transformer, luego tienes que aplicar la operación de pooling correcta encima de las embeddings de palabras contextualizadas.
from transformers import AutoTokenizer, AutoModel
import torch
# Pooling media - Ten en cuenta el mask de atención para un promedio correcto
def mean_pooling(model_output, attention_mask):
token_embeddings = model_output[0] # El primer elemento de model_output contiene todas las embeddings de tokens
input_mask_expanded = attention_mask.unsqueeze(-1).expand(token_embeddings.size()).float()
return torch.sum(token_embeddings * input_mask_expanded, 1) / torch.clamp(input_mask_expanded.sum(1), min=1e-9)
# Oraciones para las que queremos embeddings de oraciones
sentences = ['Esta es una oración de ejemplo', 'Cada oración es convertida']
# Carga el modelo desde HuggingFace Hub
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained('pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO')
model = AutoModel.from_pretrained('pritamdeka/S-PubMedBert-MS-MARCO')
# Tokeniza las oraciones
encoded_input = tokenizer(sentences, padding=True, truncation=True, return_tensors='pt')
# Calcula las embeddings de tokens
with torch.no_grad():
model_output = model(**encoded_input)
# Realiza pooling. En este caso, pooling media.
sentence_embeddings = mean_pooling(model_output, encoded_input['attention_mask'])
print("Embeddings de oraciones:")
print(sentence_embeddings)
Funcionalidades
- Modelo de sentence-transformers
- Afina el modelo BiomedNLP-PubMedBERT
- Capacidad de mapeo a espacio vectorial denso de 768 dimensiones
- Tareas de clusters o búsqueda semántica
- Optimizado para el dominio de texto médico/salud
Casos de uso
- Agrupamiento de oraciones o párrafos
- Búsqueda semántica
- Recuperación de información en el dominio del texto médico/salud