kamalkraj/BioSimCSE-BioLinkBERT-BASE

Uso (Sentence-Transformers)

Usar este modelo es fácil cuando tienes sentence-transformers instalado:

pip install -U sentence-transformers

Luego, puedes usar el modelo así:

from sentence_transformers import SentenceTransformer
sentences = ["Esta es una oración de ejemplo", "Cada oración es convertida"]

model = SentenceTransformer('kamalkraj/BioSimCSE-BioLinkBERT-BASE')
embeddings = model.encode(sentences)
print(embeddings)

Uso (Transformadores de HuggingFace)

Sin sentence-transformers, puedes usar el modelo así: Primero, pasas tu entrada a través del modelo transformer, luego tienes que aplicar la operación de agrupación correcta sobre las incrustaciones de palabras contextualizadas.

from transformers import AutoTokenizer, AutoModel
import torch

#Agrupación media - Tener en cuenta la atención de la máscara para el promedio correcto
def mean_pooling(model_output, attention_mask):
    token_embeddings = model_output[0] #El primer elemento de model_output contiene todas las incrustaciones de tokens
    input_mask_expanded = attention_mask.unsqueeze(-1).expand(token_embeddings.size()).float()
    return torch.sum(token_embeddings * input_mask_expanded, 1) / torch.clamp(input_mask_expanded.sum(1), min=1e-9)

# Oraciones para las cuales queremos las incrustaciones de oraciones
sentences = ['Esta es una oración de ejemplo', 'Cada oración es convertida']

# Cargar el modelo desde HuggingFace Hub
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained('kamalkraj/BioSimCSE-BioLinkBERT-BASE')
model = AutoModel.from_pretrained('kamalkraj/BioSimCSE-BioLinkBERT-BASE')

# Tokenizar oraciones
encoded_input = tokenizer(sentences, padding=True, truncation=True, return_tensors='pt')

# Calcular las incrustaciones de tokens
with torch.no_grad():
    model_output = model(**encoded_input)

# Realizar la agrupación. En este caso, agrupación media.
sentence_embeddings = mean_pooling(model_output, encoded_input['attention_mask'])

print("Incrustaciones de oraciones:")
print(sentence_embeddings)